Bertrand Caré
Consultant Recherche & Ingénierie Informatique Scientifiques

Bonjour ! Je suis docteur-ingénieur en informatique et chercheur en spécialisé simulation, modélisation, analyse de données et sciences du vivant.
Je suis consultant indépendant en recherche & ingénierie informatique scientifiques.
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Services

  • Vous développez une application logicielle à forte composante scientifique
    Je vous aide à concevoir et implémenter les algorithmes scientifiques clés de votre solution, ainsi que l'infrastructure pour le stockage, l'analyse et l'utilisation de vos données. Je privilégie les méthodes DevOps, Infrastructure-as-Code et le logiciel libre.
  • Vous représentez un laboratoire de recherche public ou privé
    Je réalise la conception et le prototypage des logiciels spécifiques à la recherche : moteurs de simulation, logiciels d'analyse statistique et de traitement du signal, modèles d'apprentissage automatique. Je vous assiste dans la production d'études de faisabilité et dans l'exploration d'hypothèses, en particulier en santé et biologie computationnelles et en biophysique.
  • Vous recherchez un expert polyvalent pour une mission atypique
    Je mets mon expérience de chercheur et ingénieur pluridisciplinaire à votre service.

Pour toute information, devis, consultation : bertrand.care@gmail.com,
Ou retrouvez-moi sur hopwork

Parcours

  • 2016-Présent


    Freelance,
    Toulon
    Consultant Ingénierie Informatique Scientifique

    Conception et développement logiciel orienté applications scientifiques Modélisation/simulation, infrastructure cloud, data science, consultant R&D.

  • 2013-2015


    LPTMC CNRS U7600, UPMC
    Paris
    Chercheur en biophysique

    Architecture et mécanique de la chromatine, épigénétique, physique des polymères. Développement d'une librairie de simulation moléculaire CGMDODE. Enseignements ponctuels en informatique, biologie.

  • 2009-2012


    INSA Lyon, LIRIS CNRS U5205,
    Beagle Inria, CarMeN Inserm U1060
    Doctorat Informatique/Biologie

    Signalisation cellulaire, modèles multi-agents, simulation. Enseignement informatique au département Biosciences INSA Lyon.

  • 2008-2009


    INSA Lyon
    Université Claude Bernard Lyon 1
    Master Recherche Informatique

    Apprentissage automatique, intelligence artificielle, optimisation, fouille de données.

  • 2006-2009


    INSA Lyon
    Département Biosciences
    Ingénieur Bioinformatique et Modélisation

    Biologie computationnelle et expérimentale, informatique, biostatistiques, simulation, mathématiques appliquées

Projets


CGMDODE

CGMDODE est une librairie libre C de dynamique moléculaire gros-grain

Roverpi

Robot télécommandé par WiFi embarquant un raspberry pi. Le code (client+robot) ouvert à tous

Codes

Mes autres projets hébergés sur bitbucket et github

Publications


Articles

Chapitres

Conférences

Ateliers & invitations

  • Structure de la chromatine et régulation de l'expression des gènes
    , Master Recherche Médecine Paris Diderot, 2015, Paris
  • Computational methods for supramolecular assemblies dynamics modelling
    , Séminaire laboratoire GREMAN, 2015, Tours, France
  • La modélisation en biologie cellulaire expliquée à ma mère
    , 1ères rencontres scientifiques des Grands Causses, 2015, Millau, France
  • Modélisation moléculaire des interactions biologiques : quelques exemples
    , Conférence Métier INSA Lyon département Biosciences, 2015, Lyon, France

Thèse de doctorat